Origine ethnique | Groupe d'isolants Jiaxing

Rapports scientifiques volume 13, Numéro d'article : 13271 (2023) Citer cet article

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Il a été confirmé que le polymorphisme rs2736100 (A > C) du deuxième intron de la transcriptase inverse de la télomérase (TERT) est étroitement associé au risque de cancer du poumon (LC), mais il n'existe toujours pas de conclusion unifiée sur les résultats de son association avec LC. Cette étude comprenait des études d'association pangénomiques (GWAS) et des études cas-témoins rapportées jusqu'à présent sur cette association entre le polymorphisme TERT rs2736100 et la LC afin de clarifier une telle corrélation avec la LC et ses différences entre différentes ethnies et différents types de LC. Les littératures pertinentes publiées avant le 7 mai 2022 sur le « polymorphisme TERT rs2736100 et la susceptibilité à la LC » dans les bases de données PubMed, EMbase, CENTRAL et MEDLINE ont été recherchées sur Internet et les données ont été extraites. L'analyse statistique des données a été réalisée dans le logiciel Revman5.3, notamment le dessin de diagrammes forestiers, le dessin de diagrammes en entonnoir, etc. L'analyse de la sensibilité et du biais de publication a été réalisée dans le logiciel Stata 12.0. L'allèle C de TERT rs2736100 était associé au risque de LC (Population globale : [OR] = 1,21, IC à 95 % [1,17, 1,25] ; Caucasiens : [OR] = 1,11, IC à 95 % [1,06, 1,17] ; Asiatiques : [OR] = 1,26, IC 95% [1,21, 1,30]), et les Asiatiques avaient un risque plus élevé de CL que les Caucasiens (C vs. A : Caucasiens : [OR] = 1,11 /Asiatiques : [OR]) = 1,26) . Les autres modèles génétiques ont également montré des résultats similaires. Les résultats de l'analyse stratifiée des patients LC ont montré que l'allèle C était associé au risque de carcinome pulmonaire non à petites cellules (CPNPC) et d'adénocarcinome pulmonaire (LUAD), et que le risque de CPNPC et de LUAD chez les Asiatiques était plus élevé que celui des patients asiatiques. Caucasiens. L'allèle C était associé au risque de carcinome épidermoïde du poumon (LUSC) et de carcinome du poumon à petites cellules (SCLC) chez les Asiatiques mais pas chez les Caucasiens. Les patients NSCLC ([OR] = 1,27) présentaient une corrélation plus forte que les patients SCLC ([OR] = 1,03) et les patients LUAD ([OR] = 1,32) présentaient une corrélation plus forte que les patients LUSC ([OR] = 1,09). De plus, l'allèle C de TERT rs2736100 était associé au risque de LC, NSCLC et LUAD dans les groupes fumeurs et non-fumeurs, et le risque de LC chez les non-fumeurs de différents groupes ethniques était plus élevé que chez les fumeurs. Chez les Asiatiques, les femmes non-fumeurs étaient plus à risque de développer un LUAD. L'allèle C de TERT rs2736100 est un facteur de risque de LC, NSCLC et LUAD dans différents groupes ethniques, et la population asiatique est plus à risque. L'allèle C est un facteur de risque de LUSC et de SCLC chez les Asiatiques mais pas chez les Caucasiens. Et le tabagisme n'est pas le facteur le plus critique qui entraîne une variation du TERT rs2736100 et augmente le risque de la plupart des LC (NSCLC, LUAD). La LC est donc une maladie multi-étiologique causée par une combinaison de facteurs génétiques, environnementaux et liés au mode de vie.

Le cancer du poumon (LC) est l'un des cancers ayant un taux de mortalité élevé dans le monde, représentant environ un quart de tous les décès par cancer1. Et le tabagisme est actuellement considéré comme un facteur de risque majeur2. De plus, l'exposition à des facteurs environnementaux tels que le radon, la fumée et la poussière passives, l'amiante, les fumées de cuisson et la pollution de l'air sont également les principales causes de LC chez les non-fumeurs3,4,5,6. Cependant, ce ne sont pas seulement les facteurs environnementaux, mais également les différences génétiques qui contribuent à la susceptibilité à la LC. Au cours des deux dernières décennies, des études d'association pangénomique multi-populations (GWAS) ont identifié des dizaines de locus à risque pour LC7,8, et la plupart de ces loci sont concentrés dans 5p15.33 (transcriptase inverse de la télomérase - fente labiale et fente palatine transmembranaire protéine 1) Région TERT-CLPTM1L9,10,11,12. Plusieurs études de localisation précises réalisées au cours des années suivantes ont également identifié de nouveaux loci à risque de LC dans cette région13,14,15. Les télomères sont constitués de « TTAGGG » répétés aux extrémités des chromosomes qui raccourcissent progressivement à chaque cycle de division cellulaire jusqu'à ce que l'arrêt du cycle cellulaire soit déclenché, dont le processus est connu sous le nom de sénescence réplicative16,17,18,19. Les télomères peuvent normalement être allongés par la ribonucléoprotéine télomérase pour maintenir le potentiel de réplication20,21. Dans les cellules cancéreuses humaines, cependant, la télomérase a été activée pour échapper à l’arrêt initial de la croissance et continuer à se diviser22. La croissance et la prolifération cellulaires illimitées suite à l’activation de la télomérase sont l’un des phénotypes cliniques du cancer23,24,25. Il a été prouvé que de longs télomères peuvent favoriser la survie de cellules présentant des altérations acquises de l’ADN oncogène, favorisant ainsi la tumorigenèse26,27,28. La télomérase est constituée d'un composant protéique catalytique codé par le gène TERT et d'une matrice d'ARN codée par le composant ARN de la télomérase (TERC). Parmi eux, TERT est situé sur le bras court 15.33 du chromosome 5 (5p15.33), qui est responsable du codage de la sous-unité catalytique de la télomérase29, de la régulation du niveau d'expression de la télomérase et du maintien de la longueur des télomères, de la stabilité chromosomique et de la prolifération cellulaire en ajoutant « TTAGG » se répète à la fin des chromosomes30,31.

C) polymorphism located in the second intron of TERT is the most common SNP in the TERT gene, and its association with cancer susceptibility, including LC, has been reported in various malignant tumors29. In TERT rs2736100, the C allele upregulates TERT expression in normal and LC tissues19 and is associated with longer telomere length35,43. Studies also have found that the increased telomere length of the C allele is associated with cancer44. Some studies have also shown an increased frequency of the C allele of TERT rs2736100 in LC patients9,45,46,47,48. These evidences imply that the C allele upregulates TERT expression, maintains and prolongs telomere length, and thus increases the risk of LC. In addition, some studies have conducted racial stratification analysis for different types of LC and proved that the influence of TERT variants in Asians is stronger than that in Caucasians45,49. These results in turn imply that the frequency of TERT rs2736100 variants varies across ethnic populations. However, there are some studies have not found the association between the C allele and LC50,51. The reasons for these different results may also be related to different ethnicities, countries, research methods, sample sizes, LC types, and linkage disequilibrium patterns. Therefore, there’s inconsistency in the results of the association of TERT rs2736100 with LC. While meta-analysis is an effective way to combine data to increase the sample size, obtain sufficient power to clarify inconsistent results in genetic association studies52./p> C) polymorphisms with LC up to date with the aim of clarifying its association with LC and the differences in this association between different ethnicities and different types of LC./p> 0.1 or I2< 50%), the fixed-effects model was used for statistical analysis; otherwise, the random-effects model was used for statistical analysis. The effect size and effect value of the statistical results were presented by OR value and 95% CI. Begg's Test and Egger's Test were performed in Stata 14.0 software to assess publication bias among studies, and sensitivity analysis was performed to assess the results of statistical analysis with greater heterogeneity. TSA 0.9.5.10 software was performed for the Trial sequential analysis(TSA) tests to evaluate the stability of the conclusion ((Type I error) probability = 5%, statistical test power = 80%, relative risk reduction = 20%)./p> 0.1 or I2 < 50%) and random-effects model (P < 0.1 or I2 > 50%) were used to analyze each subgroup due to the different heterogeneity of each subgroup. Meta-analysis showed that people with "C" genotype had higher risks of LC than those with "A" genotype (P < 0.00001), and Asians had higher risks of LC than Caucasians (CC vs. AA: Caucasians: [OR] = 1.33/Asians: [OR] = 1.60; CA vs. AA: Caucasians: [OR] = 1.17/Asians: [OR] = 1.26; CA + CC vs. AA: Caucasians: [OR] = 1.22/Asians: [OR] = 1.34; CC vs. AA + CA: Caucasians: [OR] = 1.19/Asians: [OR] = 1.41) (Fig. 2b–e, Table 5). It’s also found that carriers of the CC genotype ([OR] = 1.56) were more likely to develop LC than carriers of the CA genotype ([OR] = 1.25) (Table 5)./p> 0.05) (Table 7)./p> 50%), and this heterogeneity mainly exists in Asians (Table 5). In the stratified analysis, the allele model (C vs. A) of NSCLC and LUAD analysis results in the overall population also showed a certain degree of heterogeneity (P < 0.1 or I2> 50%), and this heterogeneity mainly existed in Asians (Table 6)./p> 0.05, PEgger > 0.05) (Tables 5, 6/Figs. S10–S12 in supplemental content)./p> C) polymorphism in the second intron of TERT is related to cancer44. A number of research reports have also reported that the frequency of the C allele of TERT rs2736100 increases in patients with LC9,45,46,47,48. It’s showed that the C allele can upregulate the expression of TERT, maintain and prolong telomere length, thereby increasing the risk of LC. However, due to the existence of factors such as ethnic differences, different types of LC, environmental pollution and smoking, the association between TERT rs2736100 polymorphism and LC still lacks a unified conclusion. This study included the data of GWAS and case–control studies on the association of rs2736100 polymorphism with LC that have been reported so far to clarify the association between this polymorphism and LC and the differences in the association between different ethnic groups and different types of LC./p>

C) polymorphism and lung cancer risk: a comprehensive meta-analysis. Sci Rep 13, 13271 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-40504-y/p>